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ドメインのWebサイトは外部サービスを利用し、メールはエックスサーバーを利用していますが、同一ドメインでメールマガジン機能を利用することはできますか。

いいえ。同一ドメインのWebサイトも当サービスで運用をしている必要があります。
(※メールマガジンの管理画面に、同一ドメインのWebサイトを使用します。)

この場合、初期ドメイン(サーバーID.xsrv.jp)によるメールマガジンの作成をご検討ください。