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SSIは使用できますか？

はい、SSI はご利用可能です。

.htmlや.htmでSSIを動作させたいのですが、どうすればいいでしょうか？

以下の.htaccessを設置することで、SSIを.html や .htm で動作させることが可能です。

AddHandler server-parsed .html .htm

なお、サーバー負荷とセキュリティ面からご利用の推奨はしておりません。